MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 chromosome

Total Repeats: 8603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008769	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008769	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008769	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008769	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008769	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008769	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008769	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008769	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008769	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008769	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008769	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008769	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008769	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008769	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008769	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008769	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008769	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008769	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008769	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008769	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008769	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008769	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008769	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008769	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_008769	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008769	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008769	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008769	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008769	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008769	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008769	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008769	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008769	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008769	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008769	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008769	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008769	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008769	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_008769	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008769	CAC	2	6	13576	13581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008769	CGACC	2	10	13671	13680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_008769	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008769	CGG	2	6	13701	13706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008769	GAC	2	6	14031	14036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008769	CGG	2	6	15643	15648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008769	GAC	2	6	15658	15663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008769	CCAGC	2	10	15721	15730	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_008769	GC	4	8	15729	15736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008769	CGG	2	6	15876	15881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008769	CTGA	2	8	15904	15911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008769	TTC	2	6	15938	15943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008769	GAT	3	9	16009	16017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008769	TGGC	2	8	16047	16054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008769	CCA	2	6	16077	16082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008769	GCTT	2	8	16106	16113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008769	CGG	2	6	16128	16133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008769	CAGT	2	8	16134	16141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008769	TCG	2	6	16226	16231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008769	GGC	2	6	16252	16257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008769	CGG	2	6	16356	16361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008769	GCC	2	6	16405	16410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008769	ACG	2	6	16436	16441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008769	ACC	2	6	16463	16468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008769	ACCGA	2	10	16484	16493	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008769	TGC	2	6	16494	16499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008769	CGGT	2	8	16505	16512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008769	GTC	2	6	16513	16518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008769	GCCG	2	8	16564	16571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008769	GAC	2	6	16574	16579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008769	AGC	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008769	GGC	2	6	16625	16630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008769	GC	3	6	16658	16663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008769	CCG	2	6	16668	16673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008769	ACG	2	6	16718	16723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008769	CCG	2	6	16741	16746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008769	TCG	2	6	16800	16805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008769	C	7	7	16807	16813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_008769	GAT	2	6	16815	16820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008769	CTG	2	6	16866	16871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008769	ACC	2	6	16889	16894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008769	TCG	2	6	16951	16956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008769	CGA	2	6	16976	16981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008769	TCC	2	6	16984	16989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008769	CGT	2	6	17057	17062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008769	GGT	2	6	17076	17081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008769	CGG	2	6	17105	17110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008769	GGCCGC	2	12	17177	17188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008769	TGC	2	6	17192	17197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008769	TCGA	2	8	17220	17227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008769	CGT	2	6	17264	17269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008769	GAC	2	6	17310	17315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008769	CTG	2	6	17346	17351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008769	CCG	2	6	17401	17406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008769	CCG	2	6	17437	17442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008769	GGC	2	6	17480	17485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008769	CGGT	2	8	17487	17494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008769	CGG	2	6	17504	17509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008769	GCA	2	6	17543	17548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008769	CGA	2	6	17591	17596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008769	CGC	2	6	17652	17657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008769	CTG	2	6	17667	17672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008769	ATCGGC	2	12	17673	17684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008769	TGC	2	6	17690	17695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008769	TGG	2	6	17704	17709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008769	CTG	2	6	17712	17717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008769	GCG	2	6	17758	17763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008769	CAA	2	6	17768	17773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008769	CACC	2	8	17794	17801	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_008769	CGG	2	6	17812	17817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008769	GCC	2	6	17828	17833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008769	CGT	2	6	17840	17845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008769	CCA	2	6	17851	17856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008769	TCT	2	6	17866	17871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008769	CGG	2	6	17879	17884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008769	CCCGT	2	10	17964	17973	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_008769	GGT	2	6	18026	18031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008769	ACGCCG	2	12	18093	18104	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008769	GGA	2	6	18113	18118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008769	CCG	2	6	18121	18126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008769	CGGCC	2	10	18150	18159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_008769	ACA	2	6	18160	18165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008769	GGC	2	6	18179	18184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008769	CTG	2	6	18201	18206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008769	ACC	2	6	18228	18233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008769	CGC	2	6	18275	18280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008769	CCGGG	2	10	18288	18297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008769	GCCA	2	8	18302	18309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008769	CGT	2	6	18927	18932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008769	CGC	2	6	18951	18956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008769	TCGC	2	8	19785	19792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008769	CAG	2	6	19802	19807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008769	CGTT	2	8	19820	19827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008769	AG	3	6	23387	23392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008769	CCGG	2	8	23453	23460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008769	CCG	2	6	26346	26351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008769	GCG	2	6	26438	26443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008769	TCGG	2	8	26444	26451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008769	GGGT	2	8	27055	27062	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008769	CACT	2	8	29105	29112	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008769	GGT	2	6	29148	29153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008769	GCT	2	6	29158	29163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008769	GCT	2	6	29302	29307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008769	CAC	2	6	29349	29354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_008769	AAC	2	6	29362	29367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008769	CAA	2	6	29602	29607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_008769	CGG	2	6	31310	31315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_008769	ATG	2	6	31556	31561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008769	GTT	3	9	31592	31600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008769	CTG	2	6	31604	31609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_008769	CCG	2	6	41304	41309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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421	NC_008769	GTG	2	6	177549	177554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
422	NC_008769	CAG	2	6	177559	177564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_008769	GTA	2	6	177568	177573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_008769	GAG	3	9	184112	184120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_008769	CCGG	2	8	185499	185506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
452	NC_008769	GCGT	3	12	185527	185538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
453	NC_008769	CA	3	6	186420	186425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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459	NC_008769	AC	3	6	187658	187663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
460	NC_008769	GGCT	2	8	187673	187680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
461	NC_008769	GCG	2	6	187686	187691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_008769	CGCA	2	8	187699	187706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
463	NC_008769	GA	3	6	187735	187740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_008769	GCA	2	6	190705	190710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_008769	CCA	2	6	191256	191261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_008769	CTA	2	6	191278	191283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_008769	CGT	2	6	191581	191586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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